Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms