Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms