Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX2Q13950 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms