Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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TUBA3CQ13748 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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TUBA3CQ13748 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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TUBA3CQ13748 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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TUBA3CQ13748 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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TUBA3CQ13748 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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TUBA3CQ13748 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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TUBA3CQ13748 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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TUBA3CQ13748 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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TUBA3CQ13748 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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