Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

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Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPM6BQ13491 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms