Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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FOXE3Q13461 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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FOXE3Q13461 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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FOXE3Q13461 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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FOXE3Q13461 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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FOXE3Q13461 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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FOXE3Q13461 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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FOXE3Q13461 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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FOXE3Q13461 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
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