Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms