Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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