Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
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