Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BNIP1Q12981 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BNIP1Q12981 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BNIP1Q12981 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BNIP1Q12981 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BNIP1Q12981 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BNIP1Q12981 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BNIP1Q12981 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
BNIP1Q12981 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BNIP1Q12981 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BNIP1Q12981 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BNIP1Q12981 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BNIP1Q12981 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BNIP1Q12981 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BNIP1Q12981 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BNIP1Q12981 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BNIP1Q12981 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BNIP1Q12981 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BNIP1Q12981 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BNIP1Q12981 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BNIP1Q12981 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BNIP1Q12981 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
BNIP1Q12981 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BNIP1Q12981 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BNIP1Q12981 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BNIP1Q12981 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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BNIP1Q12981 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BNIP1Q12981 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BNIP1Q12981 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BNIP1Q12981 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BNIP1Q12981 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BNIP1Q12981 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BNIP1Q12981 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BNIP1Q12981 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BNIP1Q12981 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
BNIP1Q12981 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BNIP1Q12981 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BNIP1Q12981 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BNIP1Q12981 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BNIP1Q12981 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BNIP1Q12981 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BNIP1Q12981 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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BNIP1Q12981 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
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BNIP1Q12981 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNIP1Q12981 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNIP1Q12981 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNIP1Q12981 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNIP1Q12981 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNIP1Q12981 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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BNIP1Q12981 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNIP1Q12981 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNIP1Q12981 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
BNIP1Q12981 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNIP1Q12981 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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BNIP1Q12981 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNIP1Q12981 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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BNIP1Q12981 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNIP1Q12981 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNIP1Q12981 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNIP1Q12981 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNIP1Q12981 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNIP1Q12981 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNIP1Q12981 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNIP1Q12981 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNIP1Q12981 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNIP1Q12981 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNIP1Q12981 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNIP1Q12981 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNIP1Q12981 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNIP1Q12981 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNIP1Q12981 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNIP1Q12981 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNIP1Q12981 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNIP1Q12981 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNIP1Q12981 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
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