Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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