Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TFCP2Q12800 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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