Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP1B1Q10567 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms