Protein–RNA interactions for Protein: Q07889

SOS1, Son of sevenless homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOS1Q07889 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOS1Q07889 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOS1Q07889 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOS1Q07889 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOS1Q07889 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOS1Q07889 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOS1Q07889 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOS1Q07889 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOS1Q07889 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SOS1Q07889 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOS1Q07889 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOS1Q07889 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOS1Q07889 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOS1Q07889 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOS1Q07889 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOS1Q07889 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOS1Q07889 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOS1Q07889 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOS1Q07889 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOS1Q07889 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SOS1Q07889 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOS1Q07889 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOS1Q07889 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOS1Q07889 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOS1Q07889 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOS1Q07889 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOS1Q07889 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOS1Q07889 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOS1Q07889 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOS1Q07889 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOS1Q07889 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOS1Q07889 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms