Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms