Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms