Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSC2Q02487 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms