Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms