Protein–RNA interactions for Protein: Q01518

CAP1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP1Q01518 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms