Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms