Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms