Protein–RNA interactions for Protein: P60983

GMFB, Glia maturation factor beta, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMFBP60983 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GMFBP60983 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GMFBP60983 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GMFBP60983 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GMFBP60983 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GMFBP60983 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GMFBP60983 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GMFBP60983 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GMFBP60983 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GMFBP60983 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GMFBP60983 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GMFBP60983 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMFBP60983 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMFBP60983 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMFBP60983 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMFBP60983 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMFBP60983 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMFBP60983 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMFBP60983 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMFBP60983 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMFBP60983 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMFBP60983 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMFBP60983 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMFBP60983 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMFBP60983 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMFBP60983 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMFBP60983 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMFBP60983 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMFBP60983 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMFBP60983 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMFBP60983 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMFBP60983 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMFBP60983 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMFBP60983 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMFBP60983 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMFBP60983 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMFBP60983 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMFBP60983 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMFBP60983 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMFBP60983 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMFBP60983 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMFBP60983 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMFBP60983 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMFBP60983 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMFBP60983 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMFBP60983 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMFBP60983 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMFBP60983 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMFBP60983 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMFBP60983 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMFBP60983 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMFBP60983 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMFBP60983 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMFBP60983 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMFBP60983 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMFBP60983 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMFBP60983 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMFBP60983 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMFBP60983 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMFBP60983 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMFBP60983 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMFBP60983 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMFBP60983 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMFBP60983 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMFBP60983 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GMFBP60983 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMFBP60983 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMFBP60983 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GMFBP60983 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMFBP60983 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMFBP60983 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMFBP60983 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GMFBP60983 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMFBP60983 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMFBP60983 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMFBP60983 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMFBP60983 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMFBP60983 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMFBP60983 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMFBP60983 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMFBP60983 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMFBP60983 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMFBP60983 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMFBP60983 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMFBP60983 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMFBP60983 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMFBP60983 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMFBP60983 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMFBP60983 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GMFBP60983 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GMFBP60983 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GMFBP60983 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GMFBP60983 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GMFBP60983 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GMFBP60983 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GMFBP60983 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GMFBP60983 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GMFBP60983 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GMFBP60983 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GMFBP60983 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms