Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms