Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms