Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP107P57740 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP107P57740 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP107P57740 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP107P57740 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP107P57740 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP107P57740 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP107P57740 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP107P57740 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP107P57740 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP107P57740 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP107P57740 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP107P57740 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP107P57740 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP107P57740 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP107P57740 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP107P57740 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP107P57740 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP107P57740 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP107P57740 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP107P57740 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP107P57740 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP107P57740 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP107P57740 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP107P57740 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP107P57740 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP107P57740 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP107P57740 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP107P57740 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP107P57740 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP107P57740 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP107P57740 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP107P57740 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP107P57740 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP107P57740 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP107P57740 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP107P57740 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP107P57740 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP107P57740 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP107P57740 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP107P57740 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP107P57740 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP107P57740 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP107P57740 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP107P57740 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP107P57740 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP107P57740 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP107P57740 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP107P57740 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP107P57740 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP107P57740 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP107P57740 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP107P57740 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP107P57740 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP107P57740 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP107P57740 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP107P57740 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP107P57740 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP107P57740 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP107P57740 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP107P57740 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP107P57740 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP107P57740 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP107P57740 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP107P57740 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP107P57740 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP107P57740 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP107P57740 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP107P57740 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP107P57740 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP107P57740 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP107P57740 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP107P57740 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP107P57740 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP107P57740 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP107P57740 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP107P57740 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP107P57740 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP107P57740 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP107P57740 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP107P57740 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP107P57740 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP107P57740 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP107P57740 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP107P57740 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP107P57740 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP107P57740 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP107P57740 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP107P57740 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP107P57740 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP107P57740 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP107P57740 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP107P57740 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP107P57740 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP107P57740 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP107P57740 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP107P57740 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP107P57740 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP107P57740 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP107P57740 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms