Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP7P55210 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP7P55210 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP7P55210 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP7P55210 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP7P55210 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP7P55210 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP7P55210 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP7P55210 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP7P55210 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP7P55210 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP7P55210 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP7P55210 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP7P55210 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP7P55210 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP7P55210 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP7P55210 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP7P55210 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP7P55210 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP7P55210 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP7P55210 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP7P55210 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP7P55210 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP7P55210 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP7P55210 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP7P55210 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP7P55210 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP7P55210 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP7P55210 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP7P55210 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP7P55210 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP7P55210 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP7P55210 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP7P55210 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP7P55210 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP7P55210 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP7P55210 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP7P55210 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP7P55210 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP7P55210 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP7P55210 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP7P55210 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP7P55210 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP7P55210 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP7P55210 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP7P55210 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP7P55210 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP7P55210 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP7P55210 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP7P55210 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP7P55210 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP7P55210 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP7P55210 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP7P55210 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP7P55210 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP7P55210 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP7P55210 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP7P55210 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP7P55210 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP7P55210 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP7P55210 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP7P55210 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP7P55210 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP7P55210 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP7P55210 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP7P55210 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP7P55210 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP7P55210 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP7P55210 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP7P55210 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP7P55210 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP7P55210 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP7P55210 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP7P55210 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP7P55210 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP7P55210 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP7P55210 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP7P55210 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP7P55210 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP7P55210 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP7P55210 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP7P55210 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP7P55210 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP7P55210 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP7P55210 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP7P55210 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP7P55210 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP7P55210 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP7P55210 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP7P55210 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP7P55210 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP7P55210 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP7P55210 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP7P55210 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP7P55210 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP7P55210 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP7P55210 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP7P55210 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP7P55210 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP7P55210 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms