Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms