Protein–RNA interactions for Protein: P54296

MYOM2, Myomesin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOM2P54296 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYOM2P54296 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms