Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB28P51157 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB28P51157 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB28P51157 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB28P51157 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB28P51157 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB28P51157 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB28P51157 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB28P51157 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB28P51157 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB28P51157 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB28P51157 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB28P51157 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB28P51157 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB28P51157 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB28P51157 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB28P51157 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB28P51157 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB28P51157 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB28P51157 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB28P51157 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB28P51157 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB28P51157 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB28P51157 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB28P51157 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB28P51157 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB28P51157 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB28P51157 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB28P51157 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB28P51157 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB28P51157 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB28P51157 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB28P51157 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB28P51157 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB28P51157 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB28P51157 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB28P51157 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB28P51157 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB28P51157 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB28P51157 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB28P51157 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB28P51157 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB28P51157 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB28P51157 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB28P51157 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB28P51157 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB28P51157 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB28P51157 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB28P51157 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB28P51157 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB28P51157 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB28P51157 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB28P51157 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB28P51157 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB28P51157 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB28P51157 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB28P51157 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB28P51157 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB28P51157 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB28P51157 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB28P51157 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB28P51157 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB28P51157 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB28P51157 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB28P51157 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB28P51157 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB28P51157 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB28P51157 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB28P51157 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB28P51157 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB28P51157 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB28P51157 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB28P51157 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB28P51157 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB28P51157 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB28P51157 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB28P51157 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB28P51157 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB28P51157 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB28P51157 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB28P51157 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB28P51157 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB28P51157 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB28P51157 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB28P51157 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB28P51157 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB28P51157 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB28P51157 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB28P51157 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB28P51157 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB28P51157 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB28P51157 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB28P51157 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB28P51157 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB28P51157 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB28P51157 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB28P51157 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB28P51157 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB28P51157 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB28P51157 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms