Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms