Protein–RNA interactions for Protein: P49458

SRP9, Signal recognition particle 9 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP9P49458 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRP9P49458 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SRP9P49458 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SRP9P49458 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SRP9P49458 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SRP9P49458 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SRP9P49458 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SRP9P49458 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SRP9P49458 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRP9P49458 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRP9P49458 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRP9P49458 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SRP9P49458 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRP9P49458 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SRP9P49458 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRP9P49458 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SRP9P49458 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SRP9P49458 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SRP9P49458 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SRP9P49458 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRP9P49458 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SRP9P49458 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRP9P49458 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRP9P49458 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRP9P49458 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRP9P49458 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRP9P49458 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP9P49458 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP9P49458 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP9P49458 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP9P49458 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP9P49458 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP9P49458 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP9P49458 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP9P49458 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP9P49458 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP9P49458 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP9P49458 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP9P49458 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP9P49458 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP9P49458 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP9P49458 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP9P49458 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP9P49458 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP9P49458 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP9P49458 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP9P49458 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP9P49458 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP9P49458 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP9P49458 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP9P49458 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP9P49458 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP9P49458 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP9P49458 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP9P49458 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP9P49458 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP9P49458 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP9P49458 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP9P49458 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP9P49458 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP9P49458 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP9P49458 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP9P49458 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP9P49458 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP9P49458 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP9P49458 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP9P49458 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP9P49458 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRP9P49458 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRP9P49458 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRP9P49458 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRP9P49458 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRP9P49458 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRP9P49458 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRP9P49458 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRP9P49458 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRP9P49458 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRP9P49458 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRP9P49458 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRP9P49458 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRP9P49458 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRP9P49458 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRP9P49458 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRP9P49458 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRP9P49458 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SRP9P49458 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRP9P49458 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRP9P49458 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRP9P49458 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRP9P49458 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRP9P49458 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRP9P49458 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRP9P49458 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRP9P49458 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRP9P49458 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRP9P49458 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRP9P49458 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRP9P49458 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRP9P49458 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRP9P49458 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms