Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.6 ms