Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ME1P48163 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ME1P48163 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ME1P48163 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ME1P48163 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ME1P48163 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ME1P48163 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ME1P48163 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ME1P48163 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ME1P48163 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ME1P48163 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ME1P48163 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ME1P48163 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ME1P48163 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ME1P48163 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ME1P48163 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ME1P48163 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ME1P48163 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ME1P48163 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ME1P48163 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ME1P48163 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ME1P48163 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ME1P48163 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ME1P48163 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ME1P48163 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ME1P48163 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ME1P48163 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ME1P48163 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ME1P48163 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ME1P48163 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ME1P48163 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ME1P48163 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ME1P48163 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ME1P48163 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ME1P48163 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ME1P48163 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ME1P48163 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ME1P48163 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ME1P48163 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ME1P48163 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ME1P48163 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ME1P48163 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ME1P48163 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ME1P48163 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ME1P48163 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ME1P48163 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ME1P48163 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ME1P48163 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ME1P48163 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ME1P48163 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ME1P48163 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ME1P48163 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ME1P48163 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ME1P48163 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ME1P48163 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ME1P48163 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ME1P48163 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ME1P48163 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ME1P48163 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ME1P48163 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ME1P48163 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ME1P48163 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ME1P48163 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ME1P48163 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ME1P48163 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ME1P48163 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ME1P48163 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ME1P48163 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ME1P48163 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ME1P48163 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ME1P48163 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ME1P48163 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ME1P48163 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ME1P48163 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ME1P48163 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ME1P48163 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ME1P48163 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ME1P48163 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ME1P48163 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ME1P48163 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ME1P48163 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ME1P48163 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ME1P48163 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ME1P48163 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ME1P48163 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ME1P48163 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ME1P48163 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ME1P48163 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ME1P48163 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ME1P48163 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ME1P48163 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ME1P48163 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ME1P48163 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ME1P48163 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ME1P48163 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ME1P48163 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ME1P48163 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ME1P48163 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ME1P48163 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ME1P48163 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms