Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms