Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSFMP43897 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSFMP43897 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSFMP43897 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSFMP43897 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSFMP43897 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSFMP43897 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TSFMP43897 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSFMP43897 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSFMP43897 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSFMP43897 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TSFMP43897 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSFMP43897 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSFMP43897 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSFMP43897 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSFMP43897 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSFMP43897 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TSFMP43897 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSFMP43897 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSFMP43897 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSFMP43897 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSFMP43897 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSFMP43897 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSFMP43897 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSFMP43897 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSFMP43897 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TSFMP43897 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSFMP43897 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSFMP43897 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSFMP43897 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSFMP43897 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSFMP43897 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSFMP43897 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSFMP43897 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSFMP43897 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSFMP43897 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSFMP43897 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSFMP43897 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSFMP43897 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSFMP43897 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSFMP43897 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSFMP43897 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSFMP43897 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSFMP43897 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSFMP43897 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSFMP43897 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSFMP43897 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSFMP43897 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSFMP43897 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSFMP43897 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSFMP43897 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSFMP43897 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSFMP43897 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSFMP43897 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSFMP43897 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSFMP43897 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TSFMP43897 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TSFMP43897 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TSFMP43897 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TSFMP43897 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TSFMP43897 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TSFMP43897 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TSFMP43897 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TSFMP43897 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TSFMP43897 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TSFMP43897 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TSFMP43897 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSFMP43897 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSFMP43897 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSFMP43897 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSFMP43897 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSFMP43897 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSFMP43897 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSFMP43897 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSFMP43897 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSFMP43897 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSFMP43897 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TSFMP43897 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSFMP43897 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSFMP43897 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TSFMP43897 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSFMP43897 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TSFMP43897 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSFMP43897 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSFMP43897 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSFMP43897 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSFMP43897 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSFMP43897 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSFMP43897 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TSFMP43897 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSFMP43897 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSFMP43897 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSFMP43897 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSFMP43897 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSFMP43897 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSFMP43897 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSFMP43897 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSFMP43897 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TSFMP43897 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSFMP43897 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms