Protein–RNA interactions for Protein: P43694

GATA4, Transcription factor GATA-4, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA4P43694 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA4P43694 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA4P43694 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA4P43694 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA4P43694 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA4P43694 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA4P43694 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA4P43694 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA4P43694 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA4P43694 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA4P43694 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA4P43694 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA4P43694 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA4P43694 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA4P43694 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA4P43694 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA4P43694 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA4P43694 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA4P43694 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA4P43694 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA4P43694 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA4P43694 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA4P43694 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA4P43694 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA4P43694 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA4P43694 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA4P43694 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA4P43694 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA4P43694 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA4P43694 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA4P43694 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA4P43694 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA4P43694 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA4P43694 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA4P43694 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA4P43694 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA4P43694 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA4P43694 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA4P43694 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA4P43694 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA4P43694 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA4P43694 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA4P43694 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA4P43694 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA4P43694 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA4P43694 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA4P43694 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA4P43694 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA4P43694 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA4P43694 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA4P43694 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA4P43694 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GATA4P43694 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GATA4P43694 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GATA4P43694 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GATA4P43694 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GATA4P43694 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GATA4P43694 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GATA4P43694 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GATA4P43694 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GATA4P43694 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GATA4P43694 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GATA4P43694 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GATA4P43694 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GATA4P43694 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GATA4P43694 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GATA4P43694 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GATA4P43694 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GATA4P43694 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GATA4P43694 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GATA4P43694 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GATA4P43694 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GATA4P43694 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GATA4P43694 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GATA4P43694 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GATA4P43694 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GATA4P43694 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GATA4P43694 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GATA4P43694 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GATA4P43694 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GATA4P43694 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GATA4P43694 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GATA4P43694 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GATA4P43694 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GATA4P43694 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GATA4P43694 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GATA4P43694 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GATA4P43694 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GATA4P43694 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GATA4P43694 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GATA4P43694 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GATA4P43694 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GATA4P43694 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GATA4P43694 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GATA4P43694 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GATA4P43694 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GATA4P43694 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GATA4P43694 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GATA4P43694 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GATA4P43694 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms