Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMPOP42166 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMPOP42166 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMPOP42166 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMPOP42166 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMPOP42166 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMPOP42166 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMPOP42166 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMPOP42166 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMPOP42166 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMPOP42166 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMPOP42166 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMPOP42166 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMPOP42166 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TMPOP42166 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMPOP42166 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMPOP42166 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMPOP42166 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMPOP42166 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMPOP42166 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMPOP42166 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMPOP42166 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMPOP42166 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMPOP42166 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMPOP42166 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMPOP42166 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMPOP42166 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMPOP42166 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TMPOP42166 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMPOP42166 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMPOP42166 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMPOP42166 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TMPOP42166 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMPOP42166 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMPOP42166 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMPOP42166 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMPOP42166 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMPOP42166 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMPOP42166 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMPOP42166 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMPOP42166 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMPOP42166 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TMPOP42166 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMPOP42166 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMPOP42166 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMPOP42166 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMPOP42166 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TMPOP42166 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TMPOP42166 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMPOP42166 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMPOP42166 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMPOP42166 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMPOP42166 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMPOP42166 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMPOP42166 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMPOP42166 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMPOP42166 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMPOP42166 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMPOP42166 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMPOP42166 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMPOP42166 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMPOP42166 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMPOP42166 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMPOP42166 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMPOP42166 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMPOP42166 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMPOP42166 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMPOP42166 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TMPOP42166 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMPOP42166 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMPOP42166 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TMPOP42166 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TMPOP42166 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMPOP42166 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TMPOP42166 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMPOP42166 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TMPOP42166 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMPOP42166 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMPOP42166 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMPOP42166 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMPOP42166 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMPOP42166 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMPOP42166 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMPOP42166 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMPOP42166 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMPOP42166 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMPOP42166 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMPOP42166 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMPOP42166 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMPOP42166 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMPOP42166 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMPOP42166 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMPOP42166 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMPOP42166 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TMPOP42166 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMPOP42166 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMPOP42166 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMPOP42166 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMPOP42166 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMPOP42166 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms