Protein–RNA interactions for Protein: P40313

CTRL, Chymotrypsin-like protease CTRL-1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRLP40313 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTRLP40313 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTRLP40313 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTRLP40313 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTRLP40313 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTRLP40313 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTRLP40313 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTRLP40313 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTRLP40313 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTRLP40313 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTRLP40313 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRLP40313 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRLP40313 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRLP40313 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRLP40313 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRLP40313 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRLP40313 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRLP40313 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRLP40313 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRLP40313 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRLP40313 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRLP40313 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRLP40313 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRLP40313 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRLP40313 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRLP40313 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRLP40313 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRLP40313 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRLP40313 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRLP40313 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRLP40313 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRLP40313 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRLP40313 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRLP40313 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRLP40313 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRLP40313 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRLP40313 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRLP40313 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRLP40313 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRLP40313 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRLP40313 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRLP40313 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRLP40313 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRLP40313 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRLP40313 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRLP40313 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRLP40313 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRLP40313 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRLP40313 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRLP40313 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRLP40313 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRLP40313 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRLP40313 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRLP40313 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRLP40313 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRLP40313 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRLP40313 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRLP40313 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRLP40313 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRLP40313 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRLP40313 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRLP40313 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRLP40313 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRLP40313 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRLP40313 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRLP40313 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRLP40313 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRLP40313 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRLP40313 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRLP40313 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRLP40313 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRLP40313 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRLP40313 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRLP40313 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRLP40313 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRLP40313 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRLP40313 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRLP40313 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRLP40313 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRLP40313 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRLP40313 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRLP40313 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRLP40313 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRLP40313 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRLP40313 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRLP40313 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRLP40313 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRLP40313 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRLP40313 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRLP40313 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRLP40313 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRLP40313 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRLP40313 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRLP40313 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRLP40313 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRLP40313 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRLP40313 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRLP40313 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRLP40313 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRLP40313 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms