Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2IP36954 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2IP36954 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2IP36954 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2IP36954 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2IP36954 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2IP36954 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2IP36954 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2IP36954 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2IP36954 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2IP36954 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2IP36954 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2IP36954 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2IP36954 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2IP36954 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2IP36954 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLR2IP36954 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLR2IP36954 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLR2IP36954 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLR2IP36954 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLR2IP36954 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLR2IP36954 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms