Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJA4P35212 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJA4P35212 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJA4P35212 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJA4P35212 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJA4P35212 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJA4P35212 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJA4P35212 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJA4P35212 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GJA4P35212 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJA4P35212 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJA4P35212 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJA4P35212 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJA4P35212 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GJA4P35212 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJA4P35212 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJA4P35212 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJA4P35212 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJA4P35212 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJA4P35212 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA4P35212 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA4P35212 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA4P35212 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA4P35212 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA4P35212 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA4P35212 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA4P35212 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA4P35212 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA4P35212 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA4P35212 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA4P35212 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA4P35212 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA4P35212 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA4P35212 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA4P35212 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA4P35212 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA4P35212 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA4P35212 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA4P35212 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA4P35212 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA4P35212 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA4P35212 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA4P35212 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA4P35212 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA4P35212 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA4P35212 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA4P35212 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA4P35212 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA4P35212 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA4P35212 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA4P35212 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA4P35212 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA4P35212 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA4P35212 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA4P35212 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA4P35212 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA4P35212 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA4P35212 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA4P35212 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA4P35212 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA4P35212 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA4P35212 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA4P35212 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA4P35212 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA4P35212 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA4P35212 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA4P35212 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA4P35212 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA4P35212 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA4P35212 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA4P35212 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA4P35212 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA4P35212 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA4P35212 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA4P35212 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA4P35212 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA4P35212 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA4P35212 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA4P35212 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA4P35212 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA4P35212 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA4P35212 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA4P35212 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA4P35212 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA4P35212 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA4P35212 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA4P35212 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA4P35212 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA4P35212 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA4P35212 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA4P35212 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA4P35212 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA4P35212 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA4P35212 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA4P35212 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA4P35212 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA4P35212 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA4P35212 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA4P35212 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA4P35212 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms