Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL9P32969 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL9P32969 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL9P32969 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL9P32969 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL9P32969 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL9P32969 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL9P32969 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL9P32969 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL9P32969 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL9P32969 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL9P32969 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL9P32969 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL9P32969 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL9P32969 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL9P32969 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL9P32969 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL9P32969 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL9P32969 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL9P32969 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL9P32969 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL9P32969 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL9P32969 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL9P32969 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL9P32969 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL9P32969 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL9P32969 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL9P32969 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL9P32969 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL9P32969 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL9P32969 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL9P32969 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL9P32969 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL9P32969 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL9P32969 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL9P32969 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL9P32969 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL9P32969 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL9P32969 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL9P32969 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL9P32969 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL9P32969 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL9P32969 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL9P32969 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL9P32969 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL9P32969 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL9P32969 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL9P32969 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL9P32969 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL9P32969 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL9P32969 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL9P32969 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL9P32969 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL9P32969 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL9P32969 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL9P32969 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL9P32969 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL9P32969 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL9P32969 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL9P32969 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL9P32969 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL9P32969 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL9P32969 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL9P32969 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL9P32969 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL9P32969 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL9P32969 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL9P32969 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL9P32969 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL9P32969 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL9P32969 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL9P32969 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL9P32969 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL9P32969 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL9P32969 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL9P32969 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL9P32969 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL9P32969 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL9P32969 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL9P32969 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL9P32969 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL9P32969 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL9P32969 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL9P32969 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL9P32969 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL9P32969 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL9P32969 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL9P32969 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL9P32969 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPL9P32969 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPL9P32969 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPL9P32969 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPL9P32969 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPL9P32969 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPL9P32969 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPL9P32969 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RPL9P32969 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPL9P32969 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPL9P32969 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPL9P32969 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms