Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms