Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXA10P31260 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms