Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms