Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLD1P28340 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLD1P28340 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLD1P28340 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLD1P28340 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLD1P28340 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLD1P28340 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLD1P28340 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLD1P28340 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLD1P28340 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLD1P28340 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
POLD1P28340 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLD1P28340 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
POLD1P28340 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLD1P28340 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLD1P28340 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLD1P28340 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLD1P28340 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
POLD1P28340 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLD1P28340 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLD1P28340 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLD1P28340 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
POLD1P28340 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLD1P28340 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLD1P28340 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLD1P28340 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLD1P28340 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLD1P28340 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLD1P28340 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLD1P28340 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLD1P28340 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLD1P28340 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLD1P28340 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLD1P28340 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
POLD1P28340 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
POLD1P28340 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLD1P28340 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLD1P28340 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLD1P28340 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
POLD1P28340 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLD1P28340 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLD1P28340 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLD1P28340 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLD1P28340 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLD1P28340 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLD1P28340 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLD1P28340 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLD1P28340 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLD1P28340 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLD1P28340 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLD1P28340 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLD1P28340 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLD1P28340 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLD1P28340 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLD1P28340 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
POLD1P28340 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLD1P28340 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLD1P28340 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLD1P28340 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLD1P28340 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLD1P28340 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLD1P28340 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLD1P28340 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLD1P28340 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLD1P28340 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLD1P28340 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLD1P28340 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLD1P28340 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLD1P28340 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLD1P28340 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLD1P28340 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLD1P28340 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
POLD1P28340 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLD1P28340 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLD1P28340 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLD1P28340 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLD1P28340 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLD1P28340 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLD1P28340 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLD1P28340 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLD1P28340 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLD1P28340 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
POLD1P28340 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLD1P28340 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLD1P28340 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLD1P28340 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLD1P28340 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLD1P28340 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLD1P28340 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLD1P28340 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLD1P28340 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
POLD1P28340 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLD1P28340 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLD1P28340 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLD1P28340 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLD1P28340 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLD1P28340 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLD1P28340 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLD1P28340 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLD1P28340 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms