Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMLP26374 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMLP26374 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMLP26374 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMLP26374 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMLP26374 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMLP26374 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMLP26374 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMLP26374 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMLP26374 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMLP26374 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMLP26374 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMLP26374 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMLP26374 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMLP26374 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMLP26374 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMLP26374 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMLP26374 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CHMLP26374 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMLP26374 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMLP26374 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMLP26374 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMLP26374 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMLP26374 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMLP26374 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMLP26374 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMLP26374 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMLP26374 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMLP26374 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMLP26374 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMLP26374 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMLP26374 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMLP26374 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMLP26374 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMLP26374 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMLP26374 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMLP26374 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMLP26374 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMLP26374 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMLP26374 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMLP26374 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMLP26374 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMLP26374 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMLP26374 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMLP26374 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMLP26374 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMLP26374 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMLP26374 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMLP26374 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMLP26374 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMLP26374 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMLP26374 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMLP26374 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMLP26374 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMLP26374 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMLP26374 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMLP26374 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMLP26374 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMLP26374 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMLP26374 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMLP26374 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMLP26374 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMLP26374 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMLP26374 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMLP26374 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMLP26374 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMLP26374 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMLP26374 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMLP26374 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMLP26374 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMLP26374 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHMLP26374 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHMLP26374 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHMLP26374 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHMLP26374 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CHMLP26374 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CHMLP26374 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHMLP26374 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHMLP26374 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHMLP26374 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CHMLP26374 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CHMLP26374 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHMLP26374 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHMLP26374 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHMLP26374 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHMLP26374 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHMLP26374 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHMLP26374 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHMLP26374 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHMLP26374 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHMLP26374 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHMLP26374 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHMLP26374 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHMLP26374 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHMLP26374 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHMLP26374 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHMLP26374 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHMLP26374 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHMLP26374 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHMLP26374 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms