Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DNMT1P26358 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms