Protein–RNA interactions for Protein: P25490

YY1, Transcriptional repressor protein YY1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YY1P25490 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
YY1P25490 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
YY1P25490 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
YY1P25490 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
YY1P25490 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
YY1P25490 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
YY1P25490 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
YY1P25490 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
YY1P25490 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
YY1P25490 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
YY1P25490 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
YY1P25490 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
YY1P25490 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
YY1P25490 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
YY1P25490 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
YY1P25490 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
YY1P25490 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
YY1P25490 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
YY1P25490 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
YY1P25490 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
YY1P25490 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
YY1P25490 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
YY1P25490 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
YY1P25490 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
YY1P25490 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
YY1P25490 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
YY1P25490 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
YY1P25490 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
YY1P25490 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
YY1P25490 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
YY1P25490 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
YY1P25490 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
YY1P25490 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
YY1P25490 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
YY1P25490 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
YY1P25490 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
YY1P25490 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
YY1P25490 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
YY1P25490 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
YY1P25490 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
YY1P25490 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
YY1P25490 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
YY1P25490 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
YY1P25490 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
YY1P25490 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
YY1P25490 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
YY1P25490 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
YY1P25490 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
YY1P25490 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
YY1P25490 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
YY1P25490 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
YY1P25490 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
YY1P25490 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
YY1P25490 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
YY1P25490 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
YY1P25490 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
YY1P25490 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
YY1P25490 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
YY1P25490 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
YY1P25490 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
YY1P25490 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
YY1P25490 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
YY1P25490 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
YY1P25490 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
YY1P25490 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
YY1P25490 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
YY1P25490 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
YY1P25490 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
YY1P25490 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
YY1P25490 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
YY1P25490 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
YY1P25490 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
YY1P25490 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
YY1P25490 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
YY1P25490 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
YY1P25490 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
YY1P25490 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
YY1P25490 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
YY1P25490 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
YY1P25490 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
YY1P25490 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
YY1P25490 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
YY1P25490 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
YY1P25490 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
YY1P25490 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
YY1P25490 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
YY1P25490 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
YY1P25490 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
YY1P25490 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
YY1P25490 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
YY1P25490 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
YY1P25490 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
YY1P25490 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
YY1P25490 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
YY1P25490 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
YY1P25490 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
YY1P25490 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
YY1P25490 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
YY1P25490 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
YY1P25490 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms