Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms