Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDSP20132 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDSP20132 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDSP20132 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDSP20132 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDSP20132 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDSP20132 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDSP20132 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SDSP20132 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDSP20132 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDSP20132 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDSP20132 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDSP20132 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDSP20132 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDSP20132 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDSP20132 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDSP20132 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDSP20132 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDSP20132 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDSP20132 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SDSP20132 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDSP20132 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDSP20132 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SDSP20132 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDSP20132 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDSP20132 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDSP20132 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDSP20132 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDSP20132 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDSP20132 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDSP20132 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDSP20132 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDSP20132 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SDSP20132 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDSP20132 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDSP20132 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDSP20132 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDSP20132 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDSP20132 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDSP20132 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDSP20132 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDSP20132 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDSP20132 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDSP20132 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDSP20132 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDSP20132 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDSP20132 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDSP20132 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDSP20132 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDSP20132 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDSP20132 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDSP20132 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SDSP20132 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDSP20132 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDSP20132 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDSP20132 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDSP20132 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SDSP20132 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDSP20132 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SDSP20132 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SDSP20132 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDSP20132 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDSP20132 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SDSP20132 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDSP20132 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDSP20132 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDSP20132 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDSP20132 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDSP20132 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDSP20132 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDSP20132 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDSP20132 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDSP20132 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDSP20132 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDSP20132 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDSP20132 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDSP20132 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDSP20132 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDSP20132 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDSP20132 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SDSP20132 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDSP20132 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDSP20132 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDSP20132 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDSP20132 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDSP20132 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDSP20132 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDSP20132 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDSP20132 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDSP20132 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDSP20132 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDSP20132 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDSP20132 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SDSP20132 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SDSP20132 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SDSP20132 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SDSP20132 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SDSP20132 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SDSP20132 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
SDSP20132 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
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